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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
“推文”惹祸？ 马斯克遭特斯拉股东起诉案开审******
中新网1月18日电 据美国有线电视新闻网(CNN)报道，当地时间17日，旧金山联邦法院正式挑选陪审员，就特斯拉CEO马斯克因四年前的推文遭特斯拉股东起诉一案进行审判。
资料图：特斯拉CEO马斯克据报道，马斯克曾在2018年发布推文称，他正在考虑以每股420美元的价格将特斯拉私有化，并补充道“资金已到位”，此言导致股价波动而遭股东控告。
事实证明，虽然马斯克当时确实曾与沙特主权财富基金的高管谈论过他将特斯拉私有化所需的资金，但这笔资金其实根本没“到位”。
马斯克的言论引发特斯拉股价剧烈震荡，股东认为马斯克行事鲁莽，害他们损失巨额资金，所以向法院提出诉讼。
马斯克的推文此前还引发了美国证券交易委员会(SEC)的民事诉讼，SEC要求高管说实话以保护投资者，并试图剥夺马斯克作为特斯拉CEO的职位。但SEC最终与马斯克达成和解，马斯克和特斯拉各自支付2000万美元的罚款，马斯克还放弃了公司董事长头衔，保留CEO的头衔。
此前，马斯克律师认为，对200名旧金山地区潜在陪审员的调查发现，其中116人对马斯克持负面看法，只有26人对他持正面看法。因此，他要求将股东诉讼案移交特斯拉总部所在的得州。但负责审理此案联邦地区法官上周拒绝了该要求。
历时四年多，这起诉讼直到本周才进入审判阶段。此案定于当地时间18日在旧金山联邦法院开庭辩论。法官称，陪审员审判可能持续到2月3日。马斯克很可能在审判中被传唤作证。
此外，在特拉华州法院审理的另一起“2018年特斯拉薪酬案”中，马斯克仍在等待法官的裁决。
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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